距离第一篇简书笔记（2019-8-20）已经一年有余了，本来是想在一周年的时候写一篇心路历程的，后来一想，还是等到粉丝数破千的时候再写更有意义。因为正是这些支持我的小伙伴们的...
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Dream it. Wish it. Do it.【送给所有支持我的小伙伴们】 -
暂别简书，后会有期
我不是老师，也不是大神，更不是前辈。我只是个普通的科研工作者，一个只想努力变得更好的人。 来到简书快3年了，期间写了不少的笔记。很多的笔记是在疫情严重时wfh的时候写的。至今...
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一句代码同时运行多组富集分析传统的富集分析的步骤是： 计算出差异表达基因列表 运行GO 运行KEGG当然，也可以运行其他富集分析，比如DO，Wikipathways或者Reactome等等，然后再可视化...
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RNAseq分析如何选择 参考基因组 和 gtf
转自：https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCrvsz4gAkieTWYjRQ[https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCr...
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Featurecounts：比对计数工具
按道理，featurecount应该是转录组分析中最基本的工具，但由于没有深挖其中的参数，前段时间在用它处理转录组数据时还是吃了大亏。现在将一些常用的参数记录下来： 首先在计...
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两组数据Fisher检验及结果可视化分析需求/适用场景 我们常常要比较N个元素的不同状态在两组间的分布情况，分析富集于一组的元素。那此时就可以对每个元素不同状态在两组的数量进行Fisher检验，然后通过可视化直...
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关于 MACS call ATAC-seq 数据 Peak 时候的激烈讨论（MACS3 正在开发中）
Twitter 热论：ATAC peak calling with MACS2 问题 MACS3 github专门开放了一个征对 ATAC-seq call peak 的讨论...
