为癌症患者量身定制最佳治疗方案仍是一项重大挑战。为解决这个问题，相关研究团队开发了一个肿瘤精准治疗计算框架——PERCEPTION（PERson...

单细胞Hi-C (scHi-C) 技术的出现为研究细胞周期阶段与染色质三维 (3D) 结构之间的复杂关系提供了前所未有的机会。然而，基于 scH...

定义组织中不同细胞类型的数量和丰度对于理解疾病机制以及诊断和预后目的非常重要。一般通过免疫组织学分析、细胞分选或单细胞转录组测序来实现的。或者利...

现有的时空组对齐和整合方法由于耗时极长且准确度不理想，不适用于处理大规模、基于图像的空间组学数据集。2024年7月，《Nature Commun...

细胞间通讯（CCC）的推断对于更好地理解生物系统中复杂的细胞动力学和调控机制至关重要。然而，在单细胞分辨率下准确推断空间CCC仍然是一个重大挑战...

近日，由山东第一医科大学附属省立医院（山东省立医院）“内分泌糖脂代谢与脑老化”教育部重点实验室、复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室、华大...

宏基因组测序在表征微生物组方面具有巨大优势，但目前可用的分析工具缺乏将亚种级分类分辨率和准确丰度估算与组装基因组的功能分析相结合的能力。2024...

要将全基因组关联研究（GWAS）的基因位点转化为因果变异和基因，需要从疾病相关组织中获得准确的细胞类型特异性增强子基因图谱。绘制增强子基因图谱至...

空间分辨转录组学 (SRT) 面临的一个紧迫挑战是对计算方法进行基准测试。一种广泛使用的方法是利用模拟数据。然而，目前可用的模拟 SRT 数据存...