myshu

1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据，但是V3环境中导入V5环境会报错（缺依赖包）。目前有两种方式新建R对象数据CreateSeuratO...

单细胞空间交响乐

hello，大家好，这次我们来分享一下做轨迹分析的软件----CytoTRACE,文章在Single-cell transcriptional diversity is a ...

Hayley笔记

轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 单细胞之轨迹分析-2：mono...

jjjscuedu

其实在前面也提到过Pseudotime分析，拟时间序列分析（Pseudotime分析）是通过构建细胞间的变化轨迹来重塑细胞随着时间的变化过程。从具体的分类分析和复杂程度来说，...

信你个鬼

学习资料来源： scanpy主页：https://scanpy.readthedocs.io/en/stable/[https://scanpy.readthedocs.io...

小潤澤

前言 今天介绍的这篇文章是关于用深度学习的方法预测G4序列的软件DeepG4，作者将该问题转换成分类问题，文章链接：《DeepG4: A deep learning appr...

生信宝库

前言 说到对单细胞亚群进行定义，那对很多分析单细胞数据的小伙伴来说都是最头疼的事情之一了。因为定义细胞的正确与否直接关系到后续分析所有结果的准确性，所以针对单细胞注释的解决方...