什么是哑铃图(Dumbbell Chart) 哑铃图（Dumbbell Chart）就像它的名字一样，长得像一个哑铃。当然当你有多个节点的时候，...
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R数据可视化16:哑铃图 -
收藏贴之一 | 写过热图工具的人，给你理清热图数据标准化写在前面 热图，或称热力图，是外文 Heatmap 的直译。在几乎所有数值分析相关工作中都可以看到。生物信息学数据，自然躲不过。无论是形态数据，...
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数据过滤-Trimmomatic
为什么要进行数据过滤 二代测序的下机数据经碱基识别得到的原始序列称为raw-data。raw-data中可能含有接头（adapter）、低质量序...
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TcellExTRECT 利用全外显子测序（WES）评估肿瘤免疫浸润程度TcellExTRECT应用场景 肿瘤组织的免疫微环境影响肿瘤进化，可以预测肿瘤对于免疫疗法的反应性以及治疗预后。免疫检查点抑制剂治疗已经成功的...
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PON构建的两种方法
PON构建方法一：vcftools PON构建方法二：GATK
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相关性计算与可视化画用途： 计算组间相关性，并进行可视化 1.一组数据，单个矩阵 使用示例： 输入数据示例： 代码 1，输出相关性矩阵，并用ggplot2画热图 2...
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根据bam文件推测捕获区间（bed）/获取全部基因（exon）的区间1，将UCSC的refFlat.txt转换成bed文件 基因全长bed refFlat.txt文件示例： hg19.genes.bed文件示例：...
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ggplot2 画柱形图上游数据示例： 基因A 结果示例： 基因B 两幅图组合在一起 示例： 累积柱状图 示例： 柱状图渐变色 柱状图上标数字 普通柱状图 上游数据 示例图
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两组数据Fisher检验及结果可视化分析需求/适用场景 我们常常要比较N个元素的不同状态在两组间的分布情况，分析富集于一组的元素。那此时就可以对每个元素不同状态在两组的数量进行Fi...
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如何提高FFPE变异检测质量？FFPE测序数据检测变异面临的问题 通过对大量样本进行重测序技术（全基因组、全外显子组、目标区域）以剖析癌症的致病机制，挖掘癌症相关的基因是近些...
专题公告
生物信息学相关内容，包含生物医学数据分析相关的软件，流程，统计，画图等
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